TY - JOUR AV - public TI - METODE SIDIK JARI DNA DENGAN REP-PCR UR - http://fmipa.uny.ac.id JF - Seminar Nasional Penelitian, Pendidikan, dan Penerapan MIPA 2009 ID - UNY12172 KW - sidik jari DNA KW - rep-PCR KW - REP PCR KW - ERIC PCR KW - BOX PCR SN - 978-979-96880-5-7 N2 - Analisis repetitive genomic sequences- Polymerase Chain Reaction (rep-PCR) adalah metode pelipatgandaan DNA menggunakan primer oligonukleotida untuk mengamplifikasi urutan nukleotida repetitif dalam genom mikrobia. Setiap mikroorganisme memiliki sekuen berulang (repetitive sequence) dengan jumlah dan ukuran yang sangat bervariasi. Sidik jari genomik rep-PCR yang sering digunakan ada tiga macam yaitu REPPCR, ERIC-PCR, dan BOX-PCR. Tiga macam sekuen repetitif yang telah diidentifikasi, yaitu elemen REP (Repetitive Extragenic Palindromic), ERIC (Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus), dan elemen BOX. Primer rep-PCR didesain untuk mengamplifikasi DNA diantara dua perbatasan fragmen DNA berulang pada genom bakteri. Teknik rep-PCR merupakan salah satu teknik untuk menghasilkan sidik jari genom bakteri yang dapat digunakan untuk membedakan keragaman mikrobia berdasarkan jumlah dan ukuran sekuen repetitif bakteri. Metode ini dapat digunakan sebagai salah satu metode penapisan awal isolat-isolat bakteri yang belum teridentifikasi. Selain itu juga untuk memilih isolat-isolat dengan pola amplifikasi yang berbeda untuk keperluan identifikasi lanjut. Metode ini cukup efektif dan efisien digunakan dalam sidik jari DNA bakteri Y1 - 2009/05/16/ PB - Fakultas MIPA Universitas Negeri Yogyakarta A1 - Yuyun, Farida ER -